ChromaTOF TileGCxGC-TOF-MS-Datenanalyse: Setzen Sie Ihre Daten in Chemie um

Der Umfang der GCxGC-Daten kann schnell überwältigend werden. Mehrere Tabellen mit Tausenden von Analyten können monatelanges Data Mining auf Pixelebene erfordern, um die winzigen Unterschiede zwischen Datensätzen zu finden. Selbst diese Ergebnisse sind, aufgrund der normalen chromatografischen Variation, mit falsch-positiven Ergebnissen behaftet.

ChromaTOF Tile revolutioniert die Analyse von GCxGC-Daten. Diese Software vergleicht GCxGC-Daten schnell und effizient. Statistisch signifikante Unterschiede werden weiter oben in der Liste angezeigt, sodass Sie weniger Zeit damit verbringen müssen, die Unterschiede zu finden, und mehr Zeit für die Interpretation haben.

„ChromaTOF Tile ist eine sehr hilfreiche Technologie, die unsere Peakauswahl-Zeit von 10 Tagen auf 10 Minuten reduziert hat. Wir vergleichen jetzt Gruppen von Proben mit hohem Peak-Anteil aus komplexen Studien, für die früher komplizierte, maßgeschneiderte Lösungen erforderlich gewesen wären.“

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Entwickelt für die Probengruppen-Differenzierung

Optionale Heatmap-Tabellen sind in die gesamte Benutzeroberfläche integriert, um sofortiges Feedback zu relativen Intensitäten zu geben. ChromaTOF Tile findet Unterschiede zwischen zwei oder mehreren Probenklassen, wie z. B.: Biomarker, die zwischen gesund und krank unterscheiden, Geruchsnachweise in Lebensmittelproben nach der Qualitätskontrolle, Wasserproben vor und an einer Verbrauchsstelle, Erdölproben verschiedener geografischer Herkunft und vieles weitere, was Sie sich vorstellen können.

Merkmale

  • ChromaTOF Tile ist ein eigenständiges Software-Produkt, das in Verbindung mit ChromaTOF verwendet wird
  • Alle Tabellen und Diagramme in der Benutzeroberfläche können exportiert werden, um die Berichterstellung effizienter zu gestalten, und damit Sie mit Ihren Daten mehr erreichen
  • Durch den Einsatz von Tiles werden saubere Spektren erzeugt, die für die Bibliothekssuche geeignet sind
  • Flächen der Tiles werden dazu verwendet, Trends über viele Proben hinweg annähernd zu quantifizieren

Theorie der Arbeits- und Funktionsweise

Das Problem: Der Vergleich von Chromatogrammsätzen kann ein mühsamer und langwieriger Prozess sein. Etwaige Retentionszeitverschiebungen zu kompensieren und gleichzeitig Tausende von Analyten zu zählen, kann selbst bei einer automatisierten Probenidentifizierung Tage, Wochen oder Monate dauern. Unsere Kunden haben uns darum gebeten, einen Weg zur Beschleunigung der Datenanalyse zu liefern.

Die Lösung: Mit Kundendaten von echten Proben haben wir uns daran gemacht, eine effiziente Lösung zu finden. Zusammen mit Dr. Robert Synovec stellen wir fest, dass wenn Fisher-Verhältnisse eingesetzt werden, die Daten in eine Reihe von Regionen („Kacheln“ / Tiles) unterteilt und somit die regionalisierten „Kachel-Datengruppen“, anstatt einzelner Pixel, verglichen werden können.

ChromaTOF Tile-Benutzeroberfläche

Nachdem die Werte einer Kachelregion im Wesentlichen gemittelt wurden, vergleicht die ChromaTOF Tile-Software zwei entsprechende Regionen, um die Differenz zwischen diesen Regionen zu bewerten. Die Software zeigt die Ergebnisse in grafischer Form und stellt Indikatoren für eine geringe bis hohe Varianz zwischen den Regionen zur Verfügung.

Diese grafischen Heatmaps ziehen schnell und einfach die Aufmerksam auf Bereiche mit hoher Varianz oder hoher Auffälligkeit, wodurch der Zeitaufwand für die Suche nach Datenausreißern reduziert wird. Auf einen Blick können Sie erkennen, wo die Unterschiede liegen und welche Daten Sie für Ihre Vergleiche betrachten müssen.

ChromaTOF Tile-Benutzeroberfläche mit Heatmaps

ChromaTOF Tile ändert die bereitgestellten Daten nicht. Durch den Vergleich von Kacheln anstelle von Pixeln kann das System die Anzahl der markierten Ausrichtungsverschiebungen reduzieren, um nur signifikante Unterschiede zwischen den Datensätzen zu zeigen.

Sie sind bereits ChomaTOF-Anwenderin oder -Anwender?

Hilfreiche Ressourcen anschauen, um die GCxGC-Software zu verwenden und sich damit vertraut zu machen.

„Meine Forschungsgruppe und ich freuen uns sehr, dass unsere Forschung an der University of Washington in Seattle durch die Einführung von ChromaTOF Tile zu einem erfolgreichen Ergebnis geführt hat.“ Wir gehen davon aus, dass GCxGC-Anwenderinnen und -Anwender sehr von diesem Discovery-basierten Datenanalysetool profitieren werden, um die vielen Herausforderungen zu bewältigen, die sich aus der überwachten Analyse komplexer Datensätze ergeben.“

Robert E. Synovec, Professor für Chemie, University of Washington

„Mit hochmodernen Analysemethoden wie der GCxGC-TOF-MS ist es einfach, viele Daten zu generieren. Aber nur mit der ChromaTOF Tile-Software können wir diese Daten in aussagekräftige Informationen und in Wissen umwandeln.

Hans-Gerd Janssen, wissenschaftlicher Leiter Unilever Research, Professor für Erkennungsbasierte analytische Chemie, Wageningen Universität & Forschung; und Ed Rosing, Analytical Flavour Scientist, Unilever F&E

„In der Aerosolwissenschaft sind wir häufig an den Unterschieden zwischen mehreren Probensätzen interessiert, um z. B. verschiedene Quellen oder atmosphärische Alterungssysteme zu vergleichen. Dafür hat sich ChromaTOF Tile schnell als sehr praktisches und unkompliziertes Tool für die Bewertung komplexer GCxGC-Daten erwiesen.“

Elena Hartner, Ph.D. Student, Joint Mass Spectrometry Centre, Universität Rostock und Helmholtz Zentrum München

„Bei der Durchführung von Biomarker-Discovery-Studien können Verzerrungen in Ihren Daten (z. B. Batch-Effekte) Sie auf die falsche Fährte bringen. Die PCA-Fähigkeiten von ChromaTOF Tile bieten eine schnelle und leistungsstarke Möglichkeit, um die Struktur Ihrer Daten sichtbar zu machen, einschließlich inhärenter Verzerrungen. Dies gibt die Möglichkeit, solche Verzerrungen vor oder nach statistischen Analysen zu korrigieren, was mutmaßliche Biomarker robuster macht.“

Heather D. Bean, Assistenzprofessor für Biowissenschaften, Arizona State University
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